So, hab gerade mal mit meinem Vater telefoniert. Ihm war nichts bekannt, dass Spezialbau nicht wirklich bei spannenden oder geheimnisvollen Sachen involviert war. Es wurde zwar auch viel bei den Russen auf dem Truppenübungsplatz Königsbrück gebaut, aber war nicht vollumfänglich informiert was genau gebaut wurde. Z.B. wurde für die Gebäude um die stationierten SS-20 Rakten zwar die Energieversorgung gelegt, um alles weitere kümmerten sich aber die Russen selbst, es war also (zumindest meinem Vater) nicht bekannt, dass dort Atomraketen stationiert sind.
Weiterhin hab ich noch erfahren, dass es neben dem Spezialbau noch den Betrieb "Spezialhochbau" gab, der für Stasi-Gebäude zuständig war, aber nichts mit Spezialbau Potsdam zu tun hatte (dort wurde seiner aussage nach nichts fürs MDI gebaut).
Zu deiner Frage ob auch auch zivil gebaut wurde: Immer einmal im Jahr wurde in Königsbrück ein Haus gebaut/saniert um etwas "für die Bevölkerung zu tun".